- Das DKRZ ist eine gemeinnützige und nicht kommerzielle GmbH mit vier Gesellschaftern.
- Organe des DKRZ sind die Gesellschafterversammlung und die Geschäftsführung.
- Ein Wissenschaftlicher Lenkungsausschuss (WLA) berät Geschäftsführung und Gesellschafterversammlung.
- Die DKRZ Nutzervertretung vertritt die Interessen aller Nutzer des DKRZ. Der Sprecher nimmt als Gast an den Sitzungen des WLA teil.
- Das DKRZ ist gegliedert in die Abteilungen Anwendungen, Datenanalyse, Datenmanagement, Systeme und Verwaltung.
- Der Geschäftsführer des DKRZ, Prof. Dr. Thomas Ludwig, leitet außerdem den Bereich Wissenschaftliches Rechnen der Universität Hamburg.
- Das DKRZ ist mit seinen Partnern über viele nationale und internationale Netzwerke oder gemeinsame Projekte verbunden.
Organigramm (Stand: Mai 2025):
